Instalasi Bedah Sentral (IBS) memberikan pelayanan kepada pasien yang memerlukan tindakan bedah/operasi, baik untuk kasus-kasus bedah terencana (elektif) maupun untuk kasus-kasus bedah darurat (CITO). IBS RSUD Kajen terdiri dari 6 kamar operasi non infeksius, 1 kamar operasi infeksius.